
Summer Pockets está ambientado en una isla aislada, rural y pacífica en el mar interior de Seto llamada Torishirojima, que tiene una población de aproximadamente 2,000 personas. El protagonista, Hairi Takahara, creció en un entorno urbano, pero tras un incidente desagradable, aprovecha la reciente muerte de su abuela como excusa para ir a la isla y encargarse de la venta de sus bienes.
Una vez allí, comienza a conocer a cuatro chicas, quienes son el eje central de la historia: Shiroha Naruse, que ha olvidado sus vacaciones de verano; Ao Sorakado, que está investigando las leyendas de la isla; Kamome Kushima, una chica de alta clase que busca un barco pirata; y Tsumugi Wenders, una chica más joven que intenta encontrarse a sí misma.